Para Alterar o status dos pedidos em massa, basta você selecionar os pedidos que deseja alterar o status, quando fizer isso, vai surgir uma opção com o nome Ações em massa.
Basta clicar nesta caixa e selecionar para qual status você deseja.
Dependendo do status que você selecionar, a ação seguinte muda, por exemplo, ao alterar de Pago para Faturado, irá abrir uma tela para você preencher os dados fiscais e de envio, após isso terá a tela de impressão de etiqueta.
Você pode também estar vendo como faturar pedidos em massa neste post AQUI.