Caso você não queira utilizar o mesmo preço do produto que você utiliza na sua loja física, você pode optar em criar uma lista de preço apenas para o e-commerce, e com isso oferecer preços diferentes da sua Loja Física.
Lembrando que se você possui integração com um sistema ERP, você deve criar a lista diretamente no sistema, pois é ele que vai manter os preços atualizados.
Como Criar uma Lista de Preço:
Para poder alterar os preços desta lista, você pode seguir esse tutorial: Como alterar o preço de vários produtos simultaneamente.